Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-2P42586 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms