Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syt4P40749 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt4P40749 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syt4P40749 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms