Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk2P38575 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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