Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms