Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms