Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMA1P25391 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LAMA1P25391 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms