Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd8P23463 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms