Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PparaP23204 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PparaP23204 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PparaP23204 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PparaP23204 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PparaP23204 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PparaP23204 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PparaP23204 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms