Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcaP20444 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms