Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18533 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18533 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18533 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P18533 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18533 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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