Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18530 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18530 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18530 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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