Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsdP18242 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsdP18242 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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