Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgfb3P17125 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms