Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolP11369 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PolP11369 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PolP11369 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PolP11369 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PolP11369 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PolP11369 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PolP11369 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolP11369 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolP11369 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolP11369 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PolP11369 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PolP11369 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms