Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms