Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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