Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa7P02830 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms