Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01809 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01809 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01809 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01809 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01809 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01809 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01809 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01809 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01809 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01809 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01809 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01809 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01809 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01809 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01809 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01809 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01809 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01809 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms