Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Casp8O89110 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms