Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda1O88958 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms