Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms