Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms