Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Ptpn9O35239 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Ptpn9O35239 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms