Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cnih2O35089 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cnih2O35089 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cnih2O35089 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cnih2O35089 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cnih2O35089 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cnih2O35089 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cnih2O35089 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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