Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sypl1O09117 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms