Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm3239L7N2D9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm3239L7N2D9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm3239L7N2D9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm3239L7N2D9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm3239L7N2D9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm3239L7N2D9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gm3239L7N2D9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm3239L7N2D9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm3239L7N2D9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm3239L7N2D9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm3239L7N2D9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm3239L7N2D9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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