Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms