Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms