Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms