Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms