Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx60E9PZQ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx60E9PZQ1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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