Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf217D3YYI7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf217D3YYI7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf217D3YYI7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf217D3YYI7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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