Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pdzd8B9EJ80 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pdzd8B9EJ80 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd8B9EJ80 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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