Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ssxa1B1AUS7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssxa1B1AUS7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssxa1B1AUS7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssxa1B1AUS7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssxa1B1AUS7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssxa1B1AUS7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssxa1B1AUS7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms