Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm6880A3KG45 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm6880A3KG45 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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