Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms