Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AI481877A2ALV5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AI481877A2ALV5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms