Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms