Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms