Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gria3Q9Z2W9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gria3Q9Z2W9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gria3Q9Z2W9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gria3Q9Z2W9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gria3Q9Z2W9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gria3Q9Z2W9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gria3Q9Z2W9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gria3Q9Z2W9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gria3Q9Z2W9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gria3Q9Z2W9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gria3Q9Z2W9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gria3Q9Z2W9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gria3Q9Z2W9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gria3Q9Z2W9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gria3Q9Z2W9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gria3Q9Z2W9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gria3Q9Z2W9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gria3Q9Z2W9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gria3Q9Z2W9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gria3Q9Z2W9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gria3Q9Z2W9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gria3Q9Z2W9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gria3Q9Z2W9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gria3Q9Z2W9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria3Q9Z2W9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gria3Q9Z2W9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms