Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ap3b1Q9Z1T1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ap3b1Q9Z1T1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ap3b1Q9Z1T1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ap3b1Q9Z1T1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ap3b1Q9Z1T1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ap3b1Q9Z1T1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ap3b1Q9Z1T1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ap3b1Q9Z1T1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Ap3b1Q9Z1T1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ap3b1Q9Z1T1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ap3b1Q9Z1T1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ap3b1Q9Z1T1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ap3b1Q9Z1T1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ap3b1Q9Z1T1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ap3b1Q9Z1T1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ap3b1Q9Z1T1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ap3b1Q9Z1T1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Ap3b1Q9Z1T1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ap3b1Q9Z1T1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Ap3b1Q9Z1T1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ap3b1Q9Z1T1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ap3b1Q9Z1T1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ap3b1Q9Z1T1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ap3b1Q9Z1T1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ap3b1Q9Z1T1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ap3b1Q9Z1T1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Ap3b1Q9Z1T1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ap3b1Q9Z1T1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Ap3b1Q9Z1T1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ap3b1Q9Z1T1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ap3b1Q9Z1T1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ap3b1Q9Z1T1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ap3b1Q9Z1T1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ap3b1Q9Z1T1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ap3b1Q9Z1T1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ap3b1Q9Z1T1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ap3b1Q9Z1T1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms