Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms