Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpne6Q9Z140 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpne6Q9Z140 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cpne6Q9Z140 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpne6Q9Z140 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne6Q9Z140 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne6Q9Z140 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne6Q9Z140 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne6Q9Z140 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne6Q9Z140 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne6Q9Z140 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpne6Q9Z140 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpne6Q9Z140 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpne6Q9Z140 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpne6Q9Z140 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms