Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nme4Q9WV84 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme4Q9WV84 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme4Q9WV84 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme4Q9WV84 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme4Q9WV84 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nme4Q9WV84 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nme4Q9WV84 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nme4Q9WV84 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nme4Q9WV84 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nme4Q9WV84 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nme4Q9WV84 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nme4Q9WV84 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms