Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MthfrQ9WU20 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MthfrQ9WU20 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MthfrQ9WU20 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MthfrQ9WU20 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MthfrQ9WU20 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MthfrQ9WU20 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MthfrQ9WU20 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MthfrQ9WU20 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MthfrQ9WU20 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MthfrQ9WU20 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MthfrQ9WU20 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MthfrQ9WU20 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MthfrQ9WU20 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MthfrQ9WU20 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MthfrQ9WU20 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MthfrQ9WU20 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MthfrQ9WU20 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MthfrQ9WU20 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MthfrQ9WU20 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms