Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd7Q9WTY1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd7Q9WTY1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd7Q9WTY1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdcd7Q9WTY1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcd7Q9WTY1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.8 ms