Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ5

Ramp1, Receptor activity-modifying protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp1Q9WTJ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ramp1Q9WTJ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ramp1Q9WTJ5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ramp1Q9WTJ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ramp1Q9WTJ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ramp1Q9WTJ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ramp1Q9WTJ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ramp1Q9WTJ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ramp1Q9WTJ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ramp1Q9WTJ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ramp1Q9WTJ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ramp1Q9WTJ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ramp1Q9WTJ5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ramp1Q9WTJ5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ramp1Q9WTJ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ramp1Q9WTJ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ramp1Q9WTJ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ramp1Q9WTJ5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms