Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma1Q9R1P4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psma1Q9R1P4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma1Q9R1P4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms