Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gpc6Q9R087 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc6Q9R087 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc6Q9R087 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Gpc6Q9R087 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc6Q9R087 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc6Q9R087 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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