Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CtsfQ9R013 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CtsfQ9R013 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtsfQ9R013 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtsfQ9R013 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CtsfQ9R013 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtsfQ9R013 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms